相比普通治疗肿瘤质子治疗是否更具性价比，多项研究证实，质子治疗或为更具成本效益的治疗选择。
目前我过医保暂时没有将质子治疗纳入报销范畴。质子治疗高昂的治疗费用也让很多患者及家属望而却步。然而事实上，质子治疗费用高或许只是一个表面现象。
据了解，中山大学教授钱朝南曾介绍道，质子治疗单价看似昂贵，从长远的卫生经济学来看，却是个“省钱”的治疗。美国一项长达15年的针对乳腺癌术后放疗患者的随访研究发现，接受质子治疗的乳腺癌患者初始费用是光子治疗组的3倍，而15年总医疗费用却显著低于光子治疗组。
这是因为术后接受传统光子放射医治的乳腺癌患者，其心脏和肺脏都不可避免地会受到低剂量辐射，所以对心肺功用有必定损害;而质子医治对心脏和肺脏的损害极小，患者在乳腺癌治疗后因心血管问题或呼吸系统问题去就医的次数明显减少，因而质子医治组15年总医疗费用比惯例放疗组减少了许多，并且患者死于心脏病的几率也明显下降。
