“3D”化的canSAR数据库，癌症药物研发的“大数据”

最新研究，科学家已在世界上最大的癌症药物研发数据库（canSAR）中增添了突变蛋白的3D结构数据和癌症联系网络，相关的研究发表Nucleic Acid Research杂志上。
   由伦敦癌症研究机构（ICR)研发的该数据库能够帮助伦敦以及全世界的科学家更有效的设计癌症治疗方案。2011年，ICR机构的癌症研究中心的研究人员建立了canSAR数据库，建立该数据库的目的是利用大数据的方法来建立一个详细的描述已知人类分子作用的图谱。
    canSAR数据库已经收集了数十亿的实验检测信息，描述了一百万种能够对人类蛋白产生作用的药物和化学物质，同时该数据库还将这些数据与基因信息数据以及临床实验数据合并在一起。
    最新的版本的canSAR数据库使用人工智能技术来鉴别于癌症有关的 异常蛋白表面的凹陷处和缝隙，这一步对于设计药物是非常关键的（药物封闭活性部位）。canSAR同样能够允许科学家鉴别肿瘤细胞内部的交流线，为找到新的癌症治疗方法提供了新思路。
    这个仍在增长的数据库当前拥有几乎110,000种分子的300万种蛋白凹陷的三维结构。
    英国癌症研究与ICR一起确保这些资源对于全世界的科学家来说是免费的，他们给这些科学家提供了最及时的关键信息。
   ICR机构的计算机生物学家Bissan Al-Lazikani博士是该项目小组的领导者，他说道：“我们数据库信息一直在更新和增长，目前已经是世界上最大的癌症数据库，有超过175个国家的140,000科学家为我们数据库的使用者，我们会定期的研发新的智能技术来帮助科学家做出预测和设计实验，我们的目标是癌症科学家能够使用这些数据成为生命拯救者，去完成未来最令人兴奋的癌症药物的研究。”
    科学家需要找到所有与异常基因或蛋白有关的信息，以理解新的药物能否发挥作用。这些信息信息量巨大而且分散，但是canSAR数据库将相关信息整合到一起因为能够识别隐蔽的联系和更容易地提供关键信息而增添了自身价值。
    Paul Workman教授是ICR机构的行政负责人，他说道：“canSAR数据库是大数据技术中非常重要的一部分，能够帮助科学家更有效地理解和治疗癌症，该数据库是非常有力的资源能被全世界的研究人员使用，以帮助他们更快更方便的获得生物学、化学以及癌症药物的相关知识。最新的研发已经在很大程度上提升了该数据库的力量，能够帮助科学家去选择未来癌症药物最有可能的靶向位点以及帮助他们更快更有效地实现癌症药物创新，这对全世界的癌症病人来说是非常有利的”。
    英爱癌症研究的科学信息管理员Kat Arne说道：“这个数据库包含大量的详细的科学信息，它将会促进癌症药物研发的进步，并最终拯救更多的生命。癌症药物研究是一个长期而且昂贵的过程，所以任何能够缩短时间和减少成本的方法都会加速新的癌症治疗方法的出现”。
参考文献：canSAR: an updated cancer research and drug discovery knowledgebase
（责任编辑：wzx）