近期，Nature Medicine连发2篇液体活检相关研究，刷爆了大家的朋友圈，也刷新了大家对于cfDNA基因检测的认知。“cfDNA超深度测序得出重要结论：超过50%的ctDNA突变源自白细胞、而非肿瘤细胞，即为“假阳性”由纪念斯隆·凯特琳癌症中心（MSKCC）和GRAIL公司联合研究发表，使用一种超深度测序法（测序深度为6000*），通过对124名晚期肿瘤（包括乳腺癌、肺癌、前列腺癌）患者的cfDNA、配对组织及白细胞测序分析，来研究cfDNA突变的真正来源，并明确临床测序方法测得ctDNA突变的真实性。点击查看大图点击查看大图刷新认知的结论：cfDNA测序检测到的突变，有一半以上（53.2%）源自白细胞，即由克隆性造血所造成；而与肿瘤并没有相关性。超深度测序结果显示，cfDNA与组织的一致性仅为24.4%，不到1/4。“《自然》打开另一扇门： CTC携带更全面的肿瘤基因信息更全面，CTC高通量测序可更早的预测复发和转移《自然. 医学》上发表的另一项研究，由英国肺癌研究联盟（TRACERx）发表，研究结果显示基于CTC的高通量测序（CTC-NGS）可提供更全面的肿瘤基因信息，可前瞻性了解基因变异信息，比临床影像学可提早10个月预测肿瘤复发；更重要的是肿瘤进化分析表明，CTC与转移灶是同一进化分支，即表明CTC可能为肿瘤复发的始祖细胞。研究共纳入了100位早期非小细胞肺癌患者。研究者运用高通量测序技术对肿瘤组织（原发灶多个部位、转移灶）和液体活检标本（CTC和cfDNA）进行基因分析，以及ctDNA、CTC与原发肿瘤、转移病灶的基因变异信息进行对比分析。研究表明，早期肺癌CTC能有效预测手术后的生存和复发。 令人惊艳的结果（一） CTC与原发组织的突变一致性为79%，与转移组织的突变一致性为91% 令人惊艳的结果（二） 肺癌早期CTC与10个月后转移灶基因突变一致性达到91%▲向右滑动查看全部 令人惊艳的结果（三） 肺癌早期CTC与转移灶属于同一肿瘤进化分支，是肺癌复发的直接原因▲向右滑动查看全部“循环肿瘤细胞（CTC）往往代表肿瘤侵袭能力最强的亚克隆细胞群。与 cfDNA相比，它具有完整的肿瘤细胞（包括DNA、RNA和蛋白），携带更全面的肿瘤基因遗传特征。CTC不仅能携带原发肿瘤的突变信息，也能携带数月后发生的转移灶突变信息，这提示了CTC在克服肿瘤时空异质性，提供肿瘤实时、全景基因突变谱的独特优势，CTC甚至为提前预知转移机制、明确遏制转移的治疗靶点、降低肺癌术后复发率方面，展现了巨大的临床应用潜能。随着液体活检行业和测序技术的快速发展，CTC测序作为监测癌症进展和进化机制研究有效且独特的工具，近年来已成为肿瘤领域前沿科研的新宠。CTC高通量测序(CTC NGS)研究二关于CTC测序的研究报道 随着二代测序技术和单细胞技术的发展，目前对于CTC基因测序研究，也越来越多。2015年Oncotarget曾报道 ，晚期前列腺癌CTC与组织之间全基因组织测序的相关性。结果显示：86%的CTC突变可溯源到原发组织、转移组织。其中，与原发组织的一致性为17%，与转移组织的一致性为8%，三者同时携带的突变为61%。研究结果表明，CTC携带原发组织、转移组织、更全面的肿瘤基因信息，可进行肿瘤进化分析。2016年，112名转移性乳腺癌患者研究，对其中5名乳腺癌患者的CTC、CFDNA、和原发组织进行NGS测序分析。2018年，CANCER RESEARCH报道研究显示，对12名晚期乳腺癌患者的CTC与转移组织，进行NGS突变和CNV检测，其一致性为85%。Cell Biol Toxicol (2018) 34:405–415点击查看大图
