“基因检测”一听就很高大上有木有！它能够帮您解决很多健康相关的问题，可是基因检测的报告，您看得懂吗？
随着科学技术的发展，人类基因组测序的完成，基因与人类健康的关系逐步被揭开，基因检测也开始走出实验室，走到大众的身边。
想知道酒量如何？来做个基因检测吧…
想知道患癌症的风险？来做个基因检测吧…
想知道病了用什么药效果好？来做个基因检测吧…
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基因检测能够帮您解决很多健康相关的问题，可是基因检测的报告您看的懂吗？
那一句句看起来高深莫测的专业术语，那一张张令人眼花缭乱的图片，那一个个并不复杂却难解其意的英文字母…到底是什么意思呢？今天，就让小编来帮您解读一下吧。
我们来看一份《遗传性乳腺癌和卵巢癌基因检测报告》：
检测项目
检测项目一栏显示的是这份报告检测的具体内容，也就是这个项目到底检测了您的哪个基因哪个位点。在这个项目中，我们为您检测的是BRCA1和BRCA2这两个基因的全外显子。
什么是“基因位点”和“全外显子”？
基因是一段带有遗传信息的DNA，所谓的“位点”就是DNA的基本单位脱氧核糖核苷酸，也可以直接指碱基。因为核苷酸由碱基、磷酸和脱氧核糖组成，而每个位点的磷酸和脱氧核糖都是一样的，区别只在于碱基的不同。科学家们用A、T、C和G四个字母来代表四种不同的碱基，这四种碱基不同的排列顺序组合成了各种具有不同功能的基因。而基因测序所检测的，就是某个DNA片段的碱基顺序。
而DNA的功能只是承载遗传信息，具体在我们体内执行各种生物功能的主要是各种蛋白质。DNA上的碱基顺序不同，就会被翻译成不同的氨基酸，氨基酸按特定的方式排列，就组成了各种蛋白质。
但DNA序列被翻译成氨基酸时，并不是所有的序列都被翻译的。每个基因当中都有几段序列被翻译，而中间间隔的几段序列不被翻译，被翻译的序列就叫做“外显子”，不被翻译的序列就叫做“内含子”。因此，发生在外显子上的碱基变化可能导致翻译出的氨基酸改变，从而改变对应的蛋白质及其功能，最后可能对人的健康形成威胁。而在这个项目里，我们检测BRCA1和BRCA2这两个基因的全外显子就是要看上面有没有会导致乳腺癌和卵巢癌的碱基变化。
打个比方来说，假设每个人的全基因组是一本书的话，每条染色体就对应一个章节，而每个基因呢就相当于对应章节中的一段话，至于每个位点就是这段话中的一个个字了。而这本书的特殊之处在于它只有A、T、C、G四种字，这四个字的排列组合就像一个个密码，要读懂这本书，就要先翻译出这些密码。在翻译的时候，有些字是要翻译出来的（外显子），有些字是不用翻译出来的（内含子）。如果一个字改变，那翻译出来的意思可能就不同了，这就类似于一个碱基改变就可能改变整个蛋白质的功能。
检测方法
检测方法一栏我们会写上检测这个项目使用的方法，在这个例子里，我们使用的是靶向富集目标片段并使用高通量测序进行检测的方法。因为要检测2个基因的全外显子，目标序列比较多比较长，使用高通量测序法速度较快成本较低。而为了保证结果的准确性，我们会对可疑的位点再次使用Sanger测序法进行验证。Sanger测序法是检测基因位点的金标准，准确率可达99.99%，在检测位点较少的项目中，我们通常会直接使用Sanger测序法。
其它常用的基因测序方法还有ARMS-qPCR法（例如在EGFR基因的突变检测项目中），这种方法通常会使用通过CFDA审批的标准试剂盒进行操作，结果也是非常可靠的。
检测结果和解释
报告中最重要的就是检测结果和解释：
【检测报告一】
在“检测报告一”中，该受检者的BRCA1和BRCA2两个基因未见明确致病性点突变。因此，结果解释也比较简单。
“点突变”就是指前面说到的一个碱基的改变，如果是明确的会致病的碱基改变一般被称为“突变”；而不致病的，在人群中出现频率比较高的碱基改变则一般被称为“多态性”。在这个项目中，我们共检测2个基因的20000多个碱基，“报告一”的结果是“未见明确的致病性点突变”，即没有发现明确的会致病的碱基改变。“未见明确的致病性点突变”是一种比较严谨的说法，由于科学研究的局限性，我们只能说基于目前的科研成果，没有发现明确的致病突变，而不能一口咬定说受检者就没有致病突变。
【检测报告二】
检测报告二就是一例突变阳性样本，该患者在BRCA2基因上有一个突变。外显子一栏表示的是发现的突变位点的位置，由于一个基因中的外显子是不连续的，因此就按顺序编排为Exon1、2、3…（Exon20即第20号外显子）。
第三栏显示的是突变位点，c.8632delG就是该患者的突变，c.代表后面的内容是碱基位点，8632delG就是第8632位的碱基G缺失。而后面的p.E2878Kfs*13就指代对应的氨基酸改变了，p.代表后面的内容是氨基酸，E2878K就是指第2878位的E（谷氨酸）变成了K（赖氨酸）。fs指代移码（frameshift），由于碱基在翻译的时候是3个碱基（也成为密码子）对应一个氨基酸，因此一个碱基的缺失，会导致后面所有的氨基酸密码子改变，*13代表被编码的蛋白在由2878开始的第13位氨基酸处提前终止，因此这个突变很有可能是个致病的突变。
第四栏“杂合/纯合”是指检出的突变类型，由于人的染色体是成对存在，因此在人体中，每一个基因都有双份，如果双份基因都突变就称为纯合突变，而如果一份突变一份不突变则称为杂合突变。
接下来的结果解释和结果提示中也对这一结果做出了相关的解释。
这份报告的结论就是该患者家族的乳腺癌/卵巢癌可能就是由c.8632delG这个突变引起的。
后面也有针对这个结果给出的一些建议，包括患相关肿瘤风险、适用的药物以及对家属的健康建议等。
检测结果图
报告会附上本次检测的检测结果图（见下图）：
首先是高通量测序的结果，由于是靶向富集目标片段，每条序列可能被富集了多次，在上面的图片中，每一条代表一个测序序列，而字母ATCG就代表各个位点。我们可以看到竖框框出来的就是突变位点，G代表该条带测到的碱基是G，*则代表该条带该位点缺失。在这个报告中，有些条带此位点是G，有些条带此位点缺失，这表示该患者此位点的突变是杂合的。
第二张图片是一代测序验证的结果，分别用绿、红、蓝、黑的峰代表A、T、C、G，上面的一排字母是解读软件根据测序峰图解读出的序列，黑色标出的点就是突变位点，而绿色的框则表示框内序列有不同结果，这正是由于8632位的G碱基缺失引起后续的碱基改变，因此后续的序列都会出现两种不同结果。
（责任编辑：xgh）
