实验步骤:
一、总RNA的提取
见“总RNA的提取”相关内容。
二、cDNA第一链的合成
目前试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。现以GIBICOL公司提供的SuperScriptTM Preamplification System for First Strand cDNA Synthesis 试剂盒为例。
1. 在0.5 ml微量离心管中,加入总RNA 1-5 μg,补充适量的DEPC H2O使总体积达11 μl。在管中加10 μM Oligo(dT)12-18 1 μl,轻轻混匀、离心;
2.70℃加热10min,立即将微量离心管插入冰浴中至少1min;
3. 取0.5 ml PCR管,依次加入下列试剂:第一链cDNA 2 μl;上游引物(10 pM) 2 μl;下游引物(10 pM) 2 μl;dNTP(2mM) 4 μl;10×PCR buffer 5 μl;Taq 酶(2 u/μl) 1 μl。轻轻混匀,离心。42℃孵育2-5 min;
4.加入SuperscriptⅡ1 μl ,在42℃水浴中孵育50 min;
5. 于70℃加热15 min以终止反应;
6.将管插入冰中,加入RNase H 1 μl ,37℃孵育20 min,降解残留的RNA。-20℃保存备用。
三、PCR
1.取0.5 ml PCR管,依次加入下列试剂:第一链cDNA 2 μl;上游引物(10 pM)2 μl;下游引物(10 pM)2 μl;dNTP(2 mM) 4 μl;10×PCR buffer 5 μl;Taq 酶(2 u/μl)1 μl;
2.加入适量的ddH2O,使总体积达50 μl。轻轻混匀,离心;
3.设定PCR程序。在适当的温度参数下扩增28-32个循环。为了保证实验结果的可靠与准确,可在PCR扩增目的基因时,加入一对内参(如G3PD)的特异性引物,同时扩增内参DNA,作为对照;
4.电泳鉴定:行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察结果;
5.密度扫描、结果分析:采用凝胶图像分析系统,对电泳条带进行密度扫描。
(责任编辑:sgx)