日前，位于美国加利福尼亚州旧金山的 IDbyDNA公司宣布，完成数额为900万美元的A轮融资。此轮融资由ARTIS Ventures领投，ARUP Laboratories和其它私人投资者也参与了此轮投资。IDbyDNA是一家致力于运用宏基因组学(Metagenomics)手段发现传染病病原的公司。此轮融资获得的资金将用于进一步开发基于该公司Taxonomer技术平台的DNA搜索技术，并且开展基于宏基因组学在治疗传染病方面的临床试验。
▲宏基因组分析流程（图片来源：yolasite）
传染病是世界上导致死亡的重要原因之一，而有效治疗的关键在于迅速并准确地发现病原。如今，对传染病病原的诊断已经逐渐从微生物培养测试转向分子测试。这些测试大多依靠PCR来发现与特定微生物相关的生物标记物。虽然非常灵敏，但是上述方法需要先验知识来指导寻找病原的方向。对于像肺炎，脓毒血症和脑炎等常见病来说，很多不同种病原体会导致非常相似的临床症状。这时候，只能检验少数几种病原体是否存在的PCR检测可能需要大量时间才能找到病原。
随着测序技术的发展，运用下一代测序技术（NGS）对从患者身上收集的所有微生物进行测序，然后与数据库比较发现病原体的方法理论上可以免除先验知识带来的偏见（比如将病毒感染误认为细菌感染，从而不进行病毒病原体的测试），并且可能在没有临床线索的情况下发现新的病原体。如今，随着NGS仪器的推广、测序耗材成本的降低和测序流程的简化，更多的研究人员可以进行高通量DNA或RNA测序来进行宏基因组学研究。但是，分析这些高通量DNA或RNA测序产生的庞大数据库需要由生物信息学、计算能力和微生物学专业知识构成的综合实力，而大多数实验室不具备这样的能力。因此，人们需要一种精确、快捷、使用方便的工具来帮助它们进行宏基因组学分析。
▲Taxonomer技术平台操作界面（图片来源：IDbyDNA官网）
IDbyDNA公司建立的Taxonomer技术平台是一个基于网络、使用方便的超速宏基因组序列分析系统。它运用独特的算法，能够快速地通过分析输入的DNA或RNA序列数据，找出所有不同类别的微生物种类，并且可以给出宿主mRNA的反应图谱。有的时候，宿主对病原体的反应可以为诊断病原体的种类提供宝贵的信息。例如，白细胞对病毒感染和细菌感染的反应不同，通过对白细胞mRNA图谱的分析，可以区分开病毒与细菌感染，从而知道抗菌素是否会成为有效的治疗选择。而且，Taxonomer还会把分析结果以简洁，互动的方式通过网络呈现给研究人员，从而消除了需要专门仪器和专业知识的“门槛”。自从Taxonomer分析系统在2016年5月上线以来，已经有150个科研院校，公司和政府机构的人员注册使用它来进行宏基因组学分析。
“我们正在经历一场基因组学内部的变革，这个变革以微生物组为中心，”投资方代表，ARTIS Ventures的联合创始人兼高级合伙人Stuart Peterson先生说：“虽然我们知道人体微生物组会对健康和疾病有影响，但是直到高通量测序的诞生，我们才开始理解微生物组的重要程度。IDbyDNA 公司和它们的超速宏基因组分析系统Taxonomer能够将这些信息和知识汇总起来。我们对支持这样优秀的团队非常有信心。他们是这一新兴的重要领域中的先驱。”
（责任编辑：xgh）
