最新发表在《美国国家科学院院刊》（PNAS,2011Nov7.）上的一项研究提出，一个人的生殖道内占主流的HIV-1毒株可能不是在性伙伴身上建立感染的毒株。此前的研究发现了感染艾滋病病毒的人们的生殖道内有一批病毒毒株，但是在异性性传播过程中的导致感染的毒株-这是全世界感染的主要模式-常常仍然没有得到确定。
Eric Hunter及其同事获得了卢旺达和赞比亚的8个异性恋伴侣的阴道拭纸、精液和血样，当时新近被感染的伙伴被诊断出了艾滋病病毒阳性。在8例感染中，6例涉及了女性到男性的传播。这组作者对这种病毒的外壳蛋白进行了测序，结果发现传播艾滋病病毒的伙伴的生殖道内的一种遗传变种很可能导致了对方的感染。
然而，这组作者报告说，造成感染的毒株不是长期感染艾滋病病毒的传播伙伴的生殖道内部最常见的毒株，这提示这种病毒的生殖传染病不是随机发生的。相反，这组作者提出，适合传播的毒株可能被选择出来帮助这种病毒传播给新的宿主。这组作者说，尽管几乎不可能确定在传播发生的时候病毒毒株在生殖道内的准确分布，这些发现可能有助于改善着眼于制止这种病毒传播的策略。
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