截至2016年6月底，全国医疗卫生机构数达98.9万个，其中：医院2.8万个，基层医疗卫生机构92.7万个，专业公共卫生机构3.1万个，其他机构0.3万个。与2015年6月底比较，全国医疗卫生机构增加3160个，其中：医院增加1804个，基层医疗卫生机构增加5698个，专业公共卫生机构减少4222个。
医院中：公立医院12958个，民营医院15303个。与2015年6月底比较，公立医院减少380个，民营医院增加2184个。
基层医疗卫生机构中：社区卫生服务中心(站)3.4 万个，乡镇卫生院3.7 万个，村卫生室64.3万个，诊所(医务室)19.9万个。与2015年6月底比较，诊所增加，社区卫生服务中心（站）、乡镇卫生院和村卫生室减少（见表1）。
专业公共卫生机构中：疾病预防控制中心3484个，卫生监督所（中心）3173个。与2015年6月底比较，疾病预防控制中心减少5个，卫生监督所（中心）增加44个。
各地区医疗卫生机构数见表2。
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