Science论文解读！开发出CiBER-seq新技术，可同时分析细胞中的多达100个基因

CRISPR-Cas9可以很容易地敲除或调整单个基因，以确定其对有机体或细胞，甚至另一个基因的影响。但是，如果你能一次进行几千个实验，利用CRISPR逐个对基因组中的每一个基因进行调整，并快速看到每一个基因的影响呢，那会怎么样呢？在一项新的研究中，来自美国加州大学伯克利分校的研究人员开发出一种简单的方法来做到这一点，它让任何人都可以对细胞（包括人类细胞）进行分析，并迅速确定基因组中所有调控特定基因表达的DNA序列。相关研究结果发表在2020年12月11日的Science期刊上，论文标题为“CiBER-seq dissects genetic networks by quantitative CRISPRi profiling of expression phenotypes”。CiBER-seq原理示意图，图片来自Science, 2020, doi:10.1126/science.abb9662。这种新技术，被称为CiBER-seq（CRISPR interference with barcoded expression reporter sequencing），通过让数万个CRISPR实验合并在一起，同时完成这些实验。该技术摒弃了荧光，采用深度测序的方式，直接测量合并样本（pooled sample）中基因活性的增加或减少。深度测序采用高通量、长读的新一代测序技术，对合并样本中表达的所有基因进行测序和基本计数。
（责任编辑：xsq）