2016年4月23日,中国临床肿瘤学会(CSCO)、中国肿瘤驱动基因分析联盟(CAGC)共同推出的《二代测序技术应用于临床肿瘤精准诊治的共识》(简称《共识》)一经发布,就引起了业内的高度关注。
作为我国第一个关于二代测序临床肿瘤精准诊治的共识,它的推出必将促进检测技术的规范化应用及行业的健康有序发展。
《共识》涵盖了从样本处理、测序流程、数据管理、信息分析到报告解释和咨询等9方面的内容,为相关检测的开展提供了全面、详实的指导性建议,有利于为临床提供准确可靠的检测结果。
上海南方基因组中心王升跃教授对NGS技术要求进行了说明,强调了检测需在通过审核验收的临床基因扩增检验实验室进行,且各检测实验室应参加“NGS相关的室间质量评估项目”来提供和保证检测的能力和质量。作为国内最早开展NGS肿瘤精准诊治技术研发和临床转化应用的企业,安诺优达是国家发改委首批基因检测技术应用示范中心、卫计委首批高通量测序临床应用试点单位,拥有临床基因扩增实验室资质,并积极参与卫生部临检中心多项NGS室间质评,均以优异的成绩通过了考核。
北京协和医院梁智勇教授提出NGS检测样本处理均应有明确的SOP指导,组织DNA和血浆DNA样本均应进行检测前的质量控制分析。安诺优达在NGS样本处理方面积累了大量经验,每个环节均有对应的SOP,并且通过LIMS系统,实现了样本的全流程实时化管理和监控。
另外,《共识》还对NGS数据的产生、管理和生物信息学方面提出了建议。安诺优达先后和美国Illumina公司和阿里云开展了战略合作,形成了行业一流的基因大数据生产、存储和分析能力,同时也建立了严格的数据质量控制体系,符合《共识》建议。
在我国临床肿瘤精准医学的起步阶段,就由相关临床专家推出了《共识》,行业活动从此有章可循。未来,随着大规模临床实践的开展,相信《共识》也会得到进一步的完善和细化,更好地指导日渐丰富多彩的肿瘤精准医学项目服务临床。
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