背景:方法结果2019-nCoV检测阳性组、2019-nCoV检测阴性组和暂未明确诊断组的中位年龄分别为56岁(42-67岁)、40岁(30-57岁)和52岁(35-64岁)。Dunnett检验显示,2019-nCoV检测阴性组的年龄低于2019-nCoV阳性组(t=-20.724,p<0.001)和暂未确定组(t=-4.251,p<0.001),而2019-nCoV阳性组与暂未确定组年龄差异无统计学意义(t=-2.218,p=0.052) 2019-nCoV阴性组中,第一次评估时有一例仅nCoV-NP标靶呈阳性,而在第四天重新取样和重新评估后,2019-nCov-ORF1ab和2019-nCoV-NP均呈阴性。1例2019-nCov-ORF1ab在首次评估时呈阳性,而nCoV-ORF1ab和nCoV-NP在第3天重新取样和重新评估后均呈阴性。 2019-nCoV阳性组中,两名受试者仅对2019-nCov-ORF1ab呈阳性,同一天重新取样显示相同结果,在第二天和第三天重新取样对nCov-ORF1ab和nCoV-NP显示阳性结果。6名受试者仅对nCov-ORF1ab呈阳性,第4天重新取样证实。其中1例nCoV-NP阳性,第3天复查、复样证实。42名受试,5.5天(范围2.5-7.0)后通过重新取样和再次检查确认nCoV-NP和nCoV-ORF1ab均为阴性。 2019-nCoV-NP和2019-nCoV-ORF1ab在受试人群中的阳性率分别为34.7%和34.7%。2019-nCoV-NP阳性率仅为1.5%,2019-nCoV-ORF1ab阳性率为1.5%,符合2019-nCoV诊断标准(nCoV-NP和nCoV-ORF1ab同时阳性)的占33.2%。如表2所示 受试人群按性别分为两组。图1A显示了每个年龄组诊断为2019-nCoV的患者人数。在2485名男性受试者中,882名(35.5%)被诊断为2019-nCoV感染,61名(2.5%)无法明确诊断。在3376名女性受试者中,999名(29.6%)被诊断为2019-nCov感染,74名(2.2%)无法确定(图1B) 63例鼻咽拭子标本诊断明确,但有2份痰标本显示不能判断,还有1例痰标本检测阴性,但咽拭子检测2019-nCoV为阳性(表2)。 对613份样本进行13种常见呼吸道病原体核酸检测,发现感染一种病原体感染占比14.2%(45/316)。其他病原体检测阳性率如下:甲型流感病毒5.55%(34/613)、鼻病毒4.73%(29/613)、甲型H3N2病毒4.57%(28/613)、呼吸道合胞病毒4.40%(27/613)、乙型流感病毒4.08%(25/613)、冠状病毒2.12%(13/613)、偏肺病毒1.63%(10/613)、H1N1 0.65%(4/613),腺病毒0.65%(4/613),肺炎支原体0.49%(3/613),副流感病毒0.49%(3/613),衣原体0.49%(3/613),博卡病毒0.33%(2/613)(图2a)。 212份2019-nCov阴性样本中,其他病原体感染率为18.4%(39/212)。13种呼吸道致病菌的核酸阳性率分别为:甲型流感病毒5.66%(11/202),甲型H3N2病毒5.66%(11/202),鼻病毒4.72%(10/202),呼吸道合胞病毒3.30%(7/202),乙型流感病毒2.83%(6/202),偏肺病毒1.89%(4/202),冠状病毒0.94%(2/202)(图2B)。我们基于8274份样本初步评估了2019-nCoV的实验室检测结果。在临床诊断中,虽然大多数受试者表现出明确的诊断,但有些受试者并没未出现症状。这不利于治疗潜在感染和2019-nCoV疫情的控制。此外,2019-nCoV可能与其他病原体共感染;但是,共感染病原体的类型和2019-nCoV感染的比例尚不清楚;这些共感染情况是否需要改善目前的治疗尚不清楚。对8274份密接者的样本进行进行检测发现,2745名(33.2%)检测2019-nCoV阳性,5277名(63.8%)呈阴性结果。252例(3.0%)由于只有一个靶基因呈阳性,暂时无法明确诊断。男性感染率(35.5%)高于女性(29.6%)。在104名2019-nCov检测呈阳性的患者中,5.8%的患者与其他病原体共同感染。我们的发现为临床试验、临床诊断和治疗以及2019-nCoV疫情控制提供了重要数据。 只有一个靶基因阳性的检测结果需要进一步关注。从临床测试的角度来看,这可能是因为样本采集问题。样品质量差,严重影响临床检测结果。我们比较了同一天采集的63名受试者的痰标本和鼻咽拭子标本。63例鼻咽拭子检查结果非常清楚,而痰标本Ct值为37~40,部分假阴性。这可能是因为痰不是均匀的物质。在提取核酸时,痰样的采样部位会影响提取核酸中2019-nCoV的质量和数量,进而影响检测结果。此外,痰在气管中的性质和位置也有很大的不同。这可以防止在采样过程中有效控制样本质量,从而影响检测结果,特别是在病毒尚未繁殖的感染早期患者。第二,使用咽拭子作为鼻咽部弯曲的柔韧性和形状改变,因此可以从更深的位置获得样本,这有助于收集具有较高病毒含量的样品。此外,2019年nCoV疫情目前是严重的公共卫生威胁,因此应指定具有丰富临床采样经验的人员采集样本。最后,采样时要注意环境污染,医院管理部门要建立专门的采样室和管理措施,防止样品受到环境中2019-nCoV的污染。还应考虑与样品预处理有关的问题。在对样本进行临床试验之前,需要进行核酸提取等步骤。实验操作人员和管理人员应注意实验室是否具备检测资质。实验室环境及其设备应具有防止样品交叉污染、防止人员职业暴露的能力,并配备综合消毒设备和职业暴露应急措施。只有nCovORF1ab在评估时呈阳性结果,在接下来的几天重新取样和复查后,两个目标呈阴性,因此可能发生了污染。污染可能由取样或处理过程引起。此外,熟悉所需实验技能的人员应进行分析。最后,2019年nCoV检测试剂盒应符合临床要求。 对于检测问题,检验人员和管理人员应确定所使用的试剂盒是否符合要求的标准,试剂是否妥善存放,所使用的设备是否有老化部件。 对13种呼吸道病原体的筛选结果表明,2019-nCoV可与其他病毒共感染,主要为冠状病毒2.88%(3/104),甲型流感病毒1.94%(2/104),鼻病毒1.94%(2/104),甲型 H3N2 0.96%(1/104)。因此,在治疗2019-nCoV的同时,还应治疗其他病毒。此外,2019-nCoV继发于细菌和真菌感染11株。常见的继发感染包括鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌、黄曲霉、光滑念珠菌和白色念珠菌。一些易产生耐药性的菌株(如鲍曼杆菌)的感染使治疗更加困难,患者可能发展为感染性休克。结果表明,2019例nCoV感染者多为中老年人,对感染的抵抗力普遍较低,预防性抗生素治疗可降低其死亡率和并发症。我们的结果显示,3.0%的受试者在最初的检测中只对一个靶基因呈阳性;几天后重新取样和复查发现诊断和核酸阴性的病例。由于样本数量有限,我们无法确定是否假阳性或假阴性结果的可能性更大;但是,对于初次检测中仅对一个靶基因呈阳性者,应尽可能分离观察,避免潜在的2019- nCoV感染者传播疫情。感染2019-nCoV的患者可能会感染其他病原体,这些病原体是社区性的、医源性的,或两者兼有,对此应采取预防措施,以降低医院患者之间交叉感染的风险。例如,感染2019-nCoV的患者应与其他病原体引起的肺炎患者隔离。这种隔离应包括从患者进入门诊到最终出院的治疗和监测原文来源:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.12.20022327v1 (责任编辑:xsq)