新一代测序技术(NGS)大大增进了我们对生理发育和疾病过程的理解。不过NGS的研究对象是细胞群体,忽略了这些细胞之间的异质性。正因如此,单细胞测序(SCS)技术受到了越来越多的关注。
清华大学研究团队通过单细胞RNA测序,系统重建了调控生长板(GP)发育的分子级联。这项研究发表在五月五日的Cell Reports杂志上,文章通讯作者是清华大学生命科学学院的吴琼(Qiong Wu)研究员。
生长板(GP)是骨骼延长和再生的关键结构。虽然人们已经鉴定了GP发育的一些关键调控子,但对这一过程还缺乏系统性了解。研究人员对生长板的217个细胞进行单细胞RNA测序,确定了这些细胞的基因表达谱。他们还开发了一个重建GP生理发育的信息学工具(称为Sinova),达到了很高的时空分辨率。研究人员用Sinova鉴定了指导GP成熟的有效转录因子组合,并通过体外筛选进行了验证。研究指出,这个生物信息学工具也可以用于其它的发育过程。
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