科研人员们对不同的慢性疾病进行研究，发现基本所有慢性疾病的进程都与肠道微生物密切相关。人体有70%以上的黏膜免疫发生在肠道，通过复杂的免疫机制，肠道和肠道菌群与全身各部位各器官发生紧密的联系。肠道菌群相关研究成果经常占据《自然》《科学》和《细胞》杂志封面，而这些顶级杂志也不免专门为其编发增刊，比如《科学》杂志在2016年4月29日就第二次以专刊的形式系列发表肠道菌群方面的研究。
肠道菌群
哺乳动物的肠道内存在着大量、种类众多的共生微生物群落，包括细菌、真菌、古生菌以及病毒。一个正常成人肠道内的微生物总质量可达1～1.5kg，包含的细菌数量则可达1×1014个，是人类个体真核细胞数量的10倍以上。肠道内如此庞大的微生物群落，构成了一个极为复杂的集体，即肠道菌群。
肠道菌群的研究
肠道菌群在与宿主的共同进化中，相互影响相互作用，逐渐形成了一个共生的稳态系统，它们对宿主的生长、发育、营养代谢以及免疫稳态都有着极其重要的作用，而当它们的种群数量或生活状态“失调”时，就可能导致宿主发生代谢异常、炎症等疾病，如肥胖、糖尿病、过敏、关节炎等。近年来，越来越多的研究表明，肠道菌群在肿瘤的发生发展中也起到了重要的作用。
肠道菌群对维持肠道代谢、肠道稳态以及肠道免疫系统都具有重要的作用，因此肠道菌群也直接或间接地影响肿瘤的发生发展。肠道菌群会产生多种代谢产物，这些代谢产物在肿瘤的发展中具有不同的作用，也是肠道免疫损伤过程的重要激发因素，不仅影响肠道的固有免疫反应，还能通过调控适应性免疫反应影响肿瘤生长。
一个人的肠道微生物菌群是肠道所有细菌的集合。细菌在肠道中的数量是巨大的，细菌的多样性对我们的健康至关重要。通过测序16S rRNA基因，我们能够鉴别存在于每个人肠道中的微生物。
通过动物实验、流行病学分析、临床对照试验等方法，科学家也明确了肠道的功能和健康非常容易受到各种各样因素的直接影响。其中一些因素有些是先天的，比如人自身的基因组；但更多的是后天的，特别是饮食习惯、运动、药物使用、手术等等。近年来一些研究发现了肠道微生物与免疫系统之间的密切联系，这为利用这种联系，通过选择性调节肠道细菌来改善免疫疗法提供了一条新途径。
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