高通量测序用于心脏性猝死的遗传性疾病

心肌病、心律失常综合征是常见的遗传性心脏病,占心脏性猝死(SCD)中大部分。

  近日发表在《临床化学学报》(Clinica Chimica Acta,CCA)的一项研究中,法国科学家对此进行了研究。该研究中,基于一组95个基因的高通量测序(NGS)工作流程由Illumina NextSeq500™测序仪开发,用于常见的SCD致病基因测序。筛选出90例患者(56基因型阳性,27例阴性和7个新案例)以评估这一策略的灵敏性、特异性、实用性和成本。计算机模拟分析在NextGENe软件的流程和定性化的Sophia Genetics流程中进行。

  结果显示,使用该面板定制,有效地覆盖了100%的目标序列,轻易的检测到所有先前确定的遗传变异。应用于27例基因型阴性患者,这种分子策略允许识别致病或可能致病的变异为12例。它证实了HCN4突变参与合并的心动过缓–心肌致密化不表型,并首次建议,PKP2的介入通常与心室非压实中致心律失常性右心室发育不良相关。
 
  该NGS法是一种快速、廉价、灵敏、高通量的基因突变检测方法,可以用于临床实验室,为SCD的病理生理学提供新见解,尤其是心肌病和心律失常综合征。

 
信源地址:http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0009898115300802
(责任编辑:sgx)

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